| UGT1A9 SNPs table | ||||||||||||
| Access UGT1A9 haplotypes table | ||||||||||||
| Reference sequence for the annotation: NT_005120.15 (dbSNP reference sequence) | ||||||||||||
| Rs | Observed | mRNA1 | Protein2 | DNAg3 | Nucleotide position1,4 | Comment | ||||||
| 57703499 | A/G | g.508468G>A | -4867 | |||||||||
| C/T | g.508787T>C | -4548 | Referred to -4549 in AF297093 | |||||||||
| 61691961 | A/T | g.508998T>A | -4337 | |||||||||
| 56738647 | C/T | g.509068C>T | -4267 | |||||||||
| 35505634 | -/G | g.509084_509085insG | -4251 | |||||||||
| 12471546 | A/T | g.509389A>T | -3946 | |||||||||
| 34354669 | -/T | g.509459_509460insT | -3876 | |||||||||
| 56667798 | -/T | g.509468_509469insT | -3867 | |||||||||
| 28970002 | A/G | g.509647G>A | -3688 | |||||||||
| 17868319 | C/T | g.509751C>T | -3584 | |||||||||
| 28970003 | A/G | g.509767G>A | -3568 | |||||||||
| 28970004 | C/G | g.509768C>G | -3567 | |||||||||
| 17863774 | A/T | g.509858A>T | -3477 | |||||||||
| 71398793 | -/C | g.510106delC | -3229 | |||||||||
| 28970005 | A/G | g.510482A>G | -2853 | |||||||||
| 72541405 | -/T | g.510663_510664insT | -2672 | |||||||||
| 60516912 | -/T | g.510664_510665insT | -2671 | |||||||||
| 28970006 | C/T | g.511126C>T | -2209 | Referred to -2208 in AF297093 | ||||||||
| 17868320 | C/T | g.511182C>T | -2153 | |||||||||
| 28970007 | C/T | g.511193C>T | -2142 | |||||||||
| 2924452 | A/G | g.511342C>T | -1993 | |||||||||
| 6731242 | G/T | g.511447T>G | -1888 | Referred to -1887 in AF297093 | ||||||||
| 13418420 | C/T | g.511516T>C | -1819 | Referred to -1818 in AF297093 | ||||||||
| 28970008 | A/G | g.511923A>G | -1412 | |||||||||
| 17864683 | A/C | g.511963A>C | -1372 | |||||||||
| 17864684 | A/G | g.512117G>A | -1218 | |||||||||
| 2741044 | A/G | g.512122G>A | -1213 | |||||||||
| 28970009 | C/T | g.512200C>T | -1135 | |||||||||
| 28970010 | A/G | g.512228G>A | -1107 | |||||||||
| 28969702 | C/T | g.512640C>T | -695 | |||||||||
| 3806598 | G/T | g.512646A>C | -689 | |||||||||
| 17868321 | C/T | g.512657C>T | -678 | |||||||||
| 10176426 | C/T | g.512669C>T | -666 | Referred to -665 in AF297093 | ||||||||
| 17863775 | A/G | g.512690A>G | -645 | |||||||||
| 45473696 | A/G | g.512713G>A | -622 | |||||||||
| 45570033 | A/C | g.512757A>C | -578 | |||||||||
| 45440791 | C/T | g.512814T>C | -521 | |||||||||
| 2741045 | C/T | g.512894C>T | -441 | Referred to -440 in AF297093 | ||||||||
| 2741046 | C/T | g.513003T>C | -332 | Referred to -331 in AF297093 | ||||||||
| 6714486 | A/T | g.513059T>A | -276 | Referred to -275 in AF297093 | ||||||||
| 35426722 | -/T | g.513208delT | -127 | Referred to-118 in AF297093 | ||||||||
| 17868322 | A/G | g.513248G>A | -87 | |||||||||
| A/G | c.8G>A | p.Cys3Tyr | g.513342G>A | 8 | ||||||||
| 72551329 | C/G | c.9C>G | p.Cys3Try | g.513343C>G | 9 | |||||||
| 72551330 | C/T | c.98T>C | p.Met33Thr | g.513432T>C | 98 | |||||||
| 41264153 | A/G | c.225G>A | p.Lys75Lys | g.513559G>A | 225 | |||||||
| 28946876 | A/T | c.387A>T | p.Lys129Asn | g.513721A>T | 387 | |||||||
| 66915469 | G/T | c.726T>G | p.Tyr242X | g.514060T>G | 726 | |||||||
| 17863776 | A/G | c.756G>A | p.Leu252Leu | g.514090G>A | 756 | |||||||
| 58597806 | A/G | c.766G>A | p.Asp256Asn | g.514100G>A | 766 | |||||||
| 4663870 | A/T | c.794T>A | p.Val265Glu | g.514128T>A | 794 | |||||||
| 45554333 | C/T | g.514332C>T | IVS1+143 | |||||||||
| 4663871 | A/G | g.514341G>A | IVS1+152 | |||||||||
| C/T | g.514379T>C | IVS1+190 | ||||||||||
| 2741047 | A/T | g.514408A>T | IVS1+219 | |||||||||
| 2741048 | A/C | g.514502C>A | IVS1+313 | |||||||||
| 2741049 | C/T | g.514588T>C | IVS1+399 | |||||||||
| 7349250 | A/G | g.514674A>G | IVS1+485 | |||||||||
| 45456696 | A/G | g.514759A>G | IVS1+570 | |||||||||
| 2602376 | C/T | g.514805C>T | IVS1+616 | |||||||||
| 17862856 | A/G | g.514831G>A | IVS1+642 | |||||||||
| 17862857 | C/T | g.514838C>T | IVS1+649 | |||||||||
| 2602377 | A/G | g.514966G>A | IVS1+777 | |||||||||
| 2602378 | A/T | g.515258A>T | IVS1+1069 | |||||||||
| 17862858 | A/G | g.515404A>G | IVS1+1215 | |||||||||
| 28969703 | A/G | g.515541G>A | IVS1+1352 | |||||||||
| 35881684 | -/G | g.515700_515701insG | IVS1+1511 | |||||||||
| 45539636 | C/T | g.515745T>C | IVS1+1556 | |||||||||
| 2602379 | A/G | g.515816G>A | IVS1+1627 | |||||||||
| 2741050 | A/T | g.515937T>A | IVS1+1748 | |||||||||
| 10538910 | -/TT | g.516049_516050del2 | IVS1+1860 | |||||||||
| 73108908 | A/T | g.516160T>A | IVS1+1971 | |||||||||
| 10189426 | C/T | g.516244C>T | IVS1+2055 | |||||||||
| 45488098 | C/T | g.516292T>C | IVS1+2103 | |||||||||
| 28969704 | A/G | g.516559G>A | IVS1+2370 | |||||||||
| 6720862 | A/C | g.516598C>A | IVS1+2409 | |||||||||
| 12615708 | A/G | g.516600G>A | IVS1+2411 | |||||||||
| 45447092 | A/C | g.516657A>C | IVS1+2468 | |||||||||
| 2602380 | C/T | g.517060T>C | IVS1+2871 | |||||||||
| 28969705 | A/G | g.517076A>G | IVS1+2887 | |||||||||
| 2602381 | C/T | g.517078T>C | IVS1+2889 | |||||||||
| 28969706 | A/G | g.517256A>G | IVS1+3067 | |||||||||
| 34707303 | C/T | g.517879C>T | IVS1+3690 | |||||||||
| 28969707 | C/G | g.518258G>C | IVS1+4069 | |||||||||
| 28970011 | A/G | g.518325G>A | IVS1+4136 | |||||||||
| 1Coding positions are relative to the adenine (+1) of the ATG | ||||||||||||
| 2Amino acid positions are relative to the first amino acid (+1) | ||||||||||||
| 3Genomic positions are relative to the start of the reference contig NT_005120.15 | ||||||||||||
| 4Promoter positions are relative to adenine (+1) of the ATG; Intronic positions are relative to the end of the previous exon (+1 being the first non-coding nucleotide at the end of each exon) | ||||||||||||