| UGT1A6 SNPs table | ||||||||||||
| Access UGT1A6 haplotypes table | ||||||||||||
| Reference sequence for the annotation: NT_005120.15 (dbSNP reference sequence) | ||||||||||||
| Rs | Observed | mRNA1 | Protein2 | DNAg3 | Nucleotide position1,4 | Comment | ||||||
| 10168155 | C/T | g.529590C>T | -4815 | |||||||||
| 10175809 | A/T | g.529619T>A | -4786 | |||||||||
| 10168333 | C/T | g.529742C>T | -4663 | |||||||||
| 10168416 | C/G | g.529841C>G | -4564 | |||||||||
| 28898573 | A/G | g.529916G>A | -4489 | |||||||||
| 10173355 | A/T | g.530075A>T | -4330 | |||||||||
| 11680450 | C/T | g.530237T>C | -4168 | |||||||||
| 4485562 | A/G | g.530320G>A | -4085 | |||||||||
| 10171367 | C/G | g.530421C>G | -3984 | |||||||||
| 10179094 | A/T | g.530579T>A | -3826 | |||||||||
| 17862859 | A/G | g.530596G>A | -3809 | |||||||||
| 6707947 | C/T | g.530669T>C | -3736 | |||||||||
| 6744979 | G/T | g.530870G>T | -3535 | |||||||||
| 7563561 | G/T | g.531745T>G | -2660 | |||||||||
| 7608175 | C/G | g.531843C>G | -2562 | |||||||||
| 45615240 | C/T | g.532050T>C | -2355 | |||||||||
| 12469671 | C/T | g.532160T>C | -2245 | |||||||||
| 17862860 | C/T | g.532176T>C | -2229 | |||||||||
| 28946879 | C/T | g.532180C>T | -2225 | |||||||||
| 45542536 | A/G | g.532437G>A | -1968 | |||||||||
| 28898574 | A/G | g.532666G>A | -1739 | |||||||||
| 12623271 | C/G | g.532695C>G | -1710 | |||||||||
| 28898575 | C/T | g.532718C>T | -1687 | |||||||||
| 12474980 | A/G | g.532870G>A | -1535 | |||||||||
| 45594938 | C/G | g.532904G>C | -1501 | |||||||||
| 10445704 | A/G | g.533028G>A | -1377 | |||||||||
| -/AGGAG | g.533095delAGGAG | -1310 | ||||||||||
| 45618133 | A/G | g.533178G>A | -1227 | |||||||||
| 45464992 | A/G | g.533266A>G | -1139 | |||||||||
| 45517937 | C/T | g.533287C>T | -1118 | |||||||||
| 17868327 | A/C | g.533449C>A | -956 | |||||||||
| 45607835 | A/C | g.533625A>C | -780 | |||||||||
| 45477996 | C/T | g.533688C>T | -717 | |||||||||
| 13015720 | A/G | g.533753G>A | -652 | |||||||||
| 45568235 | C/T | g.533849C>T | -556 | |||||||||
| 28899169 | C/T | g.533917C>T | -488 | |||||||||
| 12476197 | C/G | g.533978G>C | -427 | |||||||||
| 28898576 | C/G | g.534096C>G | -309 | |||||||||
| 6759892 | G/T | c.19T>G | p.Ser7Ala | g.534423T>G | 19 | |||||||
| 1042707 | A/T | c.57A>T | p.Ala19Ala | g.534461A>T | 57 | |||||||
| 45547342 | G/T | c.64G>T | p.Gly22Cys | g.534468G>T | 64 | |||||||
| 45535938 | C/T | c.105C>T | p.Asp35Asp | g.534509C>T | 105 | |||||||
| 1042708 | A/C | c.209C>A | p.Ser70Tyr | g.534613C>A | 209 | |||||||
| A/G | c.269G>A | p.Arg90His | g.534673G>A | 269 | ||||||||
| A/G | c.279A>G | p.Ser93Ser | g.534683A>G | 279 | ||||||||
| A/C | c.308C>A | p.Ser103X | g.534712C>A | 308 | ||||||||
| 1105880 | C/T | c.315A>G | p.Leu105Leu | g.534719A>G | 315 | |||||||
| 2070959 | A/G | c.541A>G | p.Thr181Ala | g.534945A>G | 541 | |||||||
| 1105879 | G/T | c.552A>C | p.Arg184Ser | g.534956A>C | 552 | |||||||
| 17863783 | G/T | c.627G>T | p.Val209Val | g.535031G>T | 627 | |||||||
| C/T | g.535374C>T | IVS1+109 | ||||||||||
| A/G | g.535385A>G | IVS1+120 | ||||||||||
| 7592281 | G/T | g.535395G>T | IVS1+130 | |||||||||
| C/T | g.535307C>T | IVS1+142 | ||||||||||
| 12478255 | A/G | g.535408G>A | IVS1+143 | |||||||||
| 45617840 | G/T | g.535426T>G | IVS1+161 | |||||||||
| 45532642 | A/G | g.535486G>A | IVS1+221 | |||||||||
| 7592624 | A/G | g.535660G>A | IVS1+395 | |||||||||
| 35761222 | -/C | g.535715_535716insC | IVS1+450 | |||||||||
| 35335423 | C/T | g.535880C>T | IVS1+615 | |||||||||
| 28898577 | C/T | g.535902C>T | IVS1+637 | |||||||||
| 45573037 | A/C | g.535950A>C | IVS1+685 | |||||||||
| 45531144 | C/T | g.536107C>T | IVS1+842 | |||||||||
| 45590837 | A/G | g.536167A>G | IVS1+902 | |||||||||
| 6761246 | A/C | g.536193A>C | IVS1+928 | |||||||||
| 17864690 | A/C | g.536324A>C | IVS1+1059 | |||||||||
| 45521138 | C/T | g.536373C>T | IVS1+1108 | |||||||||
| 71058573 | -/CTTTTTTTT | g.536533_536534ins9 | IVS1+1268 | |||||||||
| 68105043 | C/T | g.536534T>C | IVS1+1269 | |||||||||
| 34487948 | -/CTT | g.536823_536825del3 | IVS1+1558 | |||||||||
| 7607180 | C/T | g.536969C>T | IVS1+1704 | |||||||||
| 28899170 | A/C | g.536984C>A | IVS1+1719 | |||||||||
| 7607319 | C/T | g.537102C>T | IVS1+1837 | |||||||||
| 7565763 | G/T | g.537339T>G | IVS1+2074 | |||||||||
| 17864691 | C/T | g.537595C>T | IVS1+2330 | |||||||||
| 6751673 | A/G | g.537657G>A | IVS1+2392 | |||||||||
| 28899171 | G/T | g.537881G>T | IVS1+2616 | |||||||||
| 17864692 | A/G | g.538240G>A | IVS1+2975 | |||||||||
| 1604144 | A/G | g.538589C>T | IVS1+3324 | |||||||||
| 28900068 | A/G | g.538876G>A | IVS1+3611 | |||||||||
| 11894379 | A/T | g.538915T>A | IVS1+3650 | |||||||||
| 6715829 | A/T | g.538916A>T | IVS1+3651 | |||||||||
| 28898578 | A/T | g.539282A>T | IVS1+4017 | |||||||||
| 12466747 | C/G | g.539541G>C | IVS1+4276 | |||||||||
| 17863784 | A/G | g.539759G>A | IVS1+4494 | |||||||||
| 13393191 | A/G | g.539786G>A | IVS1+4521 | |||||||||
| 17868329 | A/G | g.539874A>G | IVS1+4609 | |||||||||
| 12988520 | A/C | g.540148A>C | IVS1+4883 | |||||||||
| 63663761 | C/T | g.540314C>T | IVS1+5049 | |||||||||
| 35982104 | -/T | g.540314_540315insT | IVS1+5049 | |||||||||
| 35189350 | C/G | g.540406C>G | IVS1+5141 | |||||||||
| 28898579 | C/G | g.540572G>C | IVS1+5307 | |||||||||
| 28898580 | C/T | g.540587T>C | IVS1+5322 | |||||||||
| 17863786 | A/G | g.540617A>G | IVS1+5352 | |||||||||
| 72151699 | -/T | g.540636_540637insT | IVS1+5371 | |||||||||
| 28898581 | A/G | g.540773A>G | IVS1+5508 | |||||||||
| 28898582 | C/T | g.540974T>C | IVS1+5709 | |||||||||
| 28898583 | A/G | g.541073G>A | IVS1+5808 | |||||||||
| 28898584 | A/G | g.541137A>G | IVS1+5872 | |||||||||
| 34595615 | -/G | g.541307_541308insG | IVS1+6042 | |||||||||
| 35204331 | -/A | g.541354delA | IVS1+6089 | |||||||||
| 28898585 | C/T | g.541643C>T | IVS1+6378 | |||||||||
| 35545997 | -/T | g.542036_542037insT | IVS1+6771 | |||||||||
| 28899172 | A/C | g.542435C>A | IVS1+7170 | |||||||||
| 28899173 | A/G | g.542569G>A | IVS1+7304 | |||||||||
| 28899174 | A/C | g.542717C>A | IVS1+7452 | |||||||||
| 17862863 | A/T | g.542822T>A | IVS1+7557 | |||||||||
| 17862864 | A/G | g.542836G>A | IVS1+7571 | |||||||||
| 4024061 | A/C | g.542889C>T | IVS1+7624 | |||||||||
| 28899176 | A/C | g.543039A>C | IVS1+7774 | |||||||||
| 28899177 | A/G | g.543231A>G | IVS1+7966 | |||||||||
| 17862865 | A/G | g.543293A>G | IVS1+8028 | |||||||||
| 35232566 | -/C | g.543533_543534insC | IVS1+8268 | |||||||||
| 28899178 | C/G | g.543544C>G | IVS1+8279 | |||||||||
| 17862866 | A/G | g.543666A>G | IVS1+8401 | |||||||||
| 17863787 | G/T | g.543848T>G | IVS1+8583 | |||||||||
| 35117879 | C/T | g.544052C>T | IVS1+8787 | |||||||||
| 28899179 | A/C | g.544144C>A | IVS1+8879 | |||||||||
| 7420193 | C/G | g.544277C>G | IVS1+9012 | |||||||||
| 28899180 | A/T | g.544367T>A | IVS1+9102 | |||||||||
| 28899181 | C/G | g.544467G>C | IVS1+9202 | |||||||||
| 34322175 | -/C | g.544570_544571insC | IVS1+9305 | |||||||||
| 36043462 | -/T | g.544721delT | IVS1+9456 | |||||||||
| 4439950 | A/T | g.545270A>T | IVS1+10005 | |||||||||
| 7567229 | A/C | g.545293C>A | IVS1+10028 | |||||||||
| 4521035 | A/C | g.545444A>C | IVS1+10179 | |||||||||
| 28899182 | A/G | g.545573G>A | IVS1+10308 | |||||||||
| 61589512 | -/T | g.545671delT | IVS1+10406 | |||||||||
| 11683974 | C/T | g.545754C>T | IVS1+10489 | |||||||||
| 57721875 | -/C | g.545818delC | IVS1+10553 | |||||||||
| 6722836 | A/C | g.545950A>C | IVS1+10685 | |||||||||
| 10929285 | G/T | g.546431G>T | IVS1+11166 | |||||||||
| 10180090 | A/G | g.546461G>A | IVS1+11196 | |||||||||
| 72986482 | A/G | g.546840G>A | IVS1+11575 | |||||||||
| 28898586 | A/G | g.547007A>G | IVS1+11742 | |||||||||
| 17863788 | C/T | g.547253T>C | IVS1+11988 | |||||||||
| 7564360 | A/G | g.547374G>A | IVS1+12109 | |||||||||
| 28898587 | C/T | g.547459C>T | IVS1+12194 | |||||||||
| 6725478 | C/T | g.548154C>T | IVS1+12889 | |||||||||
| 28898588 | G/T | g.548517T>G | IVS1+13252 | |||||||||
| 34619422 | -/T | g.548899delT | IVS1+13634 | |||||||||
| 12052895 | A/G | g.548931G>A | IVS1+13666 | |||||||||
| 28899183 | C/T | g.549094T>C | IVS1+13829 | |||||||||
| 28505045 | C/T | g.549106C>T | IVS1+13841 | |||||||||
| 4663325 | C/T | g.549111C>T | IVS1+13846 | |||||||||
| 4663326 | A/G | g.549325A>G | IVS1+14060 | |||||||||
| 1Coding positions are relative to the adenine (+1) of the ATG | ||||||||||||
| 2Amino acid positions are relative to the first amino acid (+1) | ||||||||||||
| 3Genomic positions are relative to the start of the reference contig NT_005120.15 | ||||||||||||
| 4Promoter positions are relative to adenine (+1) of the ATG; Intronic positions are relative to the end of the previous exon (+1 being the first non-coding nucleotide at the end of each exon) | ||||||||||||