| UGT1A4 SNPs table | ||||||||||||
| Access UGT1A4 haplotypes table | ||||||||||||
| Reference sequence for the annotation: NT_005120.15 (dbSNP reference sequence) | ||||||||||||
| Rs | Observed | mRNA1 | Protein2 | DNAg3 | Nucleotide position1,4 | Comment | ||||||
| 17862870 | A/G | g.555496G>A | -4725 | |||||||||
| 869462 | C/G | g.555516G>C | -4705 | |||||||||
| 45600634 | A/G | g.555701A>G | -4520 | |||||||||
| 4663945 | A/G | g.555871G>A | -4350 | |||||||||
| 45505392 | A/G/T | g.555877G>T | -4344 | |||||||||
| 28899184 | A/T | g.555955A>T | -4266 | |||||||||
| 28899185 | G/T | g.556098T>G | -4123 | |||||||||
| 12477216 | C/T | g.556421C>T | -3800 | |||||||||
| 35623965 | -/AT | g.556774_556775ins2 | -3447 | |||||||||
| 72084011 | -/AT | g.556775_556776ins2 | -3446 | |||||||||
| 6749496 | C/T | g.557040T>C | -3181 | |||||||||
| 17862871 | C/T | g.557128C>T | -3093 | |||||||||
| 28898603 | C/T | g.557459T>C | -2762 | |||||||||
| 17868334 | A/G | g.557571A>G | -2650 | |||||||||
| 17863791 | C/T | g.557638T>C | -2583 | |||||||||
| 28948390 | C/G | g.557653C>G | -2568 | |||||||||
| 17868335 | A/C | g.557737C>A | -2484 | |||||||||
| 17863792 | A/G | g.557880G>A | -2341 | |||||||||
| 17864696 | A/C | g.557948A>C | -2273 | |||||||||
| 17874943 | A/G | g.557993A>G | -2228 | |||||||||
| 6744284 | C/T | g.558051C>T | -2170 | |||||||||
| 34344862 | -/C | g.558070_558071insC | -2151 | |||||||||
| 28898604 | A/G | g.558131A>G | -2090 | |||||||||
| 28898605 | A/G | g.558248A>G | -1973 | |||||||||
| 1875263 | C/T | g.558376C>T | -1845 | |||||||||
| 28898606 | A/G | g.558397G>A | -1824 | |||||||||
| 3806595 | A/T | g.558472T>A | -1749 | |||||||||
| 28898607 | A/G | g.558639G>A | -1582 | |||||||||
| 3806594 | A/G | g.558644T>C | -1577 | |||||||||
| 3806593 | C/T | g.558673A>G | -1548 | |||||||||
| 3806592 | A/G | g.558690C>T | -1531 | |||||||||
| 11676072 | A/G | g.558737A>G | -1484 | |||||||||
| 3806591 | A/G | g.558953T>C | -1268 | |||||||||
| 869283 | A/G | g.559041G>A | -1180 | |||||||||
| 28898608 | A/G | g.559410G>A | -811 | |||||||||
| 45569333 | A/T | g.559551T>A | -670 | |||||||||
| 28898609 | C/G | g.559570C>G | -651 | |||||||||
| 1846780 | G/T | g.559726G>T | -495 | |||||||||
| 3732221 | A/G | g.559764C>T | -457 | |||||||||
| 3732220 | C/T | g.559802G>A | -419 | |||||||||
| 3732219 | A/G | g.560002C>T | -219 | |||||||||
| G/T | g.560004G>T | -217 | ||||||||||
| 45454101 | A/G | g.560017G>A | -204 | |||||||||
| 3732218 | C/T | g.560058G>A | -163 | |||||||||
| A/G | g.560185G>A | -36 | ||||||||||
| 72551336 | A/G | c.17A>G | p.Gln6Arg | g.560237A>G | 17 | |||||||
| A/G | c.30G>A | p.Pro10Pro | g.560250G>A | 30 | ||||||||
| 3892221 | C/T | c.31C>T | p.Arg11Try | g.560251C>T | 31 | |||||||
| 62191899 | A/G | c.42A>G | p.Thr42Thr | g.560262A>G | 42 | |||||||
| 6755571 | A/C | c.70C>A | p.Pro24Thr | g.560290C>A | 70 | |||||||
| -/A | c.127delA | p.43fxX22 | g.560347delA | 127 | ||||||||
| 2011425 | G/T | c.142T>G | p.Leu48Val | g.560362T>G | 142 | |||||||
| 58554624 | G/T | c.142T>G | p.Leu48Val | g.560362T>G | 142 | |||||||
| 45510694 | C/G | c.150G>C | p.Glu50Asp | g.560370G>C | 150 | |||||||
| 45571233 | A/C | c.165C>A | p.Gly55Gly | g.560385C>A | 165 | |||||||
| -/G | c.175delG | p.59fsX6 | g.560395delG | 175 | ||||||||
| 45621441 | C/T | c.202C>T | p.His68Tyr | g.560422C>T | 202 | |||||||
| C/T | c.271C>T | p.Arg91Cys | g.560491C>T | 271 | ||||||||
| A/G | c.325A>G | p.Arg109Gly | g.560545A>G | 325 | ||||||||
| 28898610 | C/T | c.339T>C | p.Ser113Ser | g.560559T>C | 339 | |||||||
| C/T | c.357T>C | p.Asn119Asn | g.560577T>C | 357 | ||||||||
| 72551337 | C/T | c.395T>C | p.Leu132Pro | g.560615T>C | 395 | |||||||
| 12468274 | C/T | c.448T>C | p.Leu150Leu | g.560668T>C | 448 | |||||||
| 2011404 | C/T | c.471T>C | p.Cys157Cys | g.560691T>C | 471 | |||||||
| 45467894 | A/G | c.477G>A | p.Ala159Ala | g.560697G>A | 477 | |||||||
| 45516494 | A/G | c.483G>A | p.Leu161Leu | g.560703G>A | 483 | |||||||
| 45540231 | A/T | c.526A>T | p.Ile176Phe | g.560746A>T | 526 | |||||||
| 3732217 | C/T | c.804G>A | p.Pro268Pro | g.561024G>A | 804 | |||||||
| G/T | g.561088G>T | IVS+1 | ||||||||||
| 2011219 | C/T | g.561130C>T | IVS1+43 | |||||||||
| A/G | g.561185A>G | IVS1+98 | ||||||||||
| G/T | g.561188G>T | IVS1+101 | ||||||||||
| 28898611 | C/G | g.561280G>C | IVS1+193 | |||||||||
| 871514 | A/G | g.561283T>C | IVS1+196 | |||||||||
| 904855 | C/G | g.561330G>C | IVS1+243 | |||||||||
| 28898612 | A/G | g.561344A>G | IVS1+257 | |||||||||
| 904856 | A/G | g.561401A>G | IVS1+314 | |||||||||
| 13401281 | G/T | g.561433T>G | IVS1+346 | |||||||||
| 12466779 | C/T | g.561448C>T | IVS1+361 | |||||||||
| 12463641 | C/G | g.561469G>C | IVS1+382 | |||||||||
| 12468356 | A/G | g.561501A>G | IVS1+414 | |||||||||
| 61612736 | A/G | g.561622A>G | IVS1+535 | |||||||||
| 28898613 | A/G | g.561831G>A | IVS1+744 | |||||||||
| 12468543 | A/G | g.561993A>G | IVS1+906 | |||||||||
| 12463910 | A/G | g.562145G>A | IVS1+1058 | |||||||||
| 62191900 | A/T | g.562270A>T | IVS1+1183 | |||||||||
| 71398798 | -/TT | g.562271_562272ins2 | IVS1+1184 | |||||||||
| 71694891 | -/TT | g.562272_562273ins2 | IVS1+1185 | |||||||||
| 72356620 | -/TTT | g.562281_562282ins3 | IVS1+1194 | |||||||||
| 72466079 | -/TT | g.562282_562283ins2 | IVS1+1195 | |||||||||
| 72160285 | -/TT | g.562283_562284ins2 | IVS1+1196 | |||||||||
| 60621337 | -/T | g.562290delT | IVS1+1203 | |||||||||
| 71058575 | -/TT | g.562290_562291ins2 | IVS1+1203 | |||||||||
| 71423610 | A/G | g.562295G>A | IVS1+1208 | |||||||||
| 28899186 | G/T | g.562339G>T | IVS1+1252 | |||||||||
| 28898614 | A/C | g.562580C>A | IVS1+1493 | |||||||||
| 10929293 | A/T | g.562940A>T | IVS1+1853 | |||||||||
| 7597496 | A/G | g.563197A>G | IVS1+2110 | |||||||||
| 12475934 | A/G | g.563257G>A | IVS1+2170 | |||||||||
| 58524075 | A/G | g.563365A>G | IVS1+2278 | |||||||||
| 62191901 | G/T | g.563468G>T | IVS1+2381 | |||||||||
| 12479208 | C/T | g.563654C>T | IVS1+2567 | |||||||||
| 28899187 | A/T | g.563721T>A | IVS1+2634 | |||||||||
| 28898615 | C/T | g.563761T>C | IVS1+2674 | |||||||||
| 72231748 | -/TT | g.564246_564247ins2 | IVS1+3159 | |||||||||
| 61550889 | -/TT | g.564259_564260ins2 | IVS1+3172 | |||||||||
| 11677089 | A/T | g.564601A>T | IVS1+3514 | |||||||||
| 6760025 | C/T | g.564675T>C | IVS1+3588 | |||||||||
| 6750992 | A/C | g.564884C>A | IVS1+3797 | |||||||||
| 1Coding positions are relative to the adenine (+1) of the ATG | ||||||||||||
| 2Amino acid positions are relative to the first amino acid (+1) | ||||||||||||
| 3Genomic positions are relative to the start of the reference contig NT_005120.15 | ||||||||||||
| 4Promoter positions are relative to adenine (+1) of the ATG; Intronic positions are relative to the end of the previous exon (+1 being the first non-coding nucleotide at the end of each exon) | ||||||||||||